靈活用工與勞務派遣在多個方面存在顯著差異：

1. 支付對價的對象不同：勞務派遣是一種勞務合同關系，用工單位通過派遣企業向員工支付工資，員工向用工單位提供勞動服務，企業針對勞動力的使用支付對價。靈活用工是一種承包合同關系，企業針對完成的工作成果支付對價。

2. 業務獨立性不同：因靈活用工針對的是具體業務，因此靈活用工服務供應商需要主導業務的進程，管理現場人員。勞務派遣則由實際用工單位控制業務進展，派遣員工完全受控于用工單位，由用工單位對其進行管理，勞務派遣機構不涉及認可用工單位的業務問題。

3. 費用核算的周期不同：勞務派遣人員與用工單位的正式員工相同，由用工單位按月將其工資支付給派遣機構，派遣機構再支付給派遣員工，因此派遣機構與用工單位之間通常是按照月進行結算的。而靈活用工的費用則完全由靈活用工服務機構進行發放，提供勞工的供應商與用工單位之間往往是基于合作的業務發展程度和周期結算。

4. 給付員工工資的標準不同：勞務派遣員工被派遣至用工單位工作，通常按照用工單位的正式員工，實行同工同酬。靈活用工的費用則完全由靈活用工服務機構進行發放。

總的來說，靈活用工與勞務派遣在支付對價的對象、業務的獨立性、費用核算的周期以及給付員工工資的標準等方面均存在顯著差異。具體選擇哪種方式，需要依據企業的實際需求和情況來決定。